L’IH.SM a été créé en 1992 (décret ministériel n°92/1026 du 09/12/92) à la suite de la fusion de 3 entités : la Station Marine, la filière Océanologie Appliquée et l’Unité de Formation Supérieure Halieutique.

Il a pour mission la Formation et la Recherche en matières de Pêche et de l’Aquaculture, d’Environnement marin et littoral.

L’IH.SM est chargé notamment de la Formation des Techniciens Supérieurs - des Ingénieurs Halieutes et des Océanographes biologistes (Maîtrise, DEA et Doctorat). Par ailleurs, il peut assurer le recyclage des agents des entreprises selon leurs besoins.

Les activités au sein de l’IH.SM sont coordonnées par une équipe permanente et des assistants techniques étrangers

L’Institut Halieutique et des Sciences Marines est un etablisement public qui a pour mission la Formation et la Recherche en matières de Pêche et de l’Aquaculture, d’Environnement marin et littoral.
Il offre une game de formations allant de la Formation academique ( Ingeniorat,Maitrise, DEA et Doctorat en Oceanologie Appliquee) a la formation professionnelle (Agents des entreprises halieutiques et aquacoles) en passant par la formation professionnalisante (Techniciens Superieurs de la Mer et du Littoral). Le programme de formation est axe essentiellement sur la Gestion durable des Ressources naturelles et le Contrôle de qualite des produits halieutiques.

Par ailleurs, l’IH.SM developpe un programme de Recheche Appliquee au Developpement avec des partenaires etrangers et prives dans le domaine de la Gestion des Stocks des ressources marines a haute valeur marchande telles que les langoustes, les crevettes d’eaux profondes, et les cephalopodes ( poulpes, calmars) ; l’Institut fait egalement la promotion de l’Aquaculture des especes commerciales telles que le concombre de mer, l’artemia, la spiruline, l’algue Euchema, l’huitre de Fort Dauphin etc…

Le programme de la Reduction de la Pollution marine et cotiere est realise en partenariat avec le Centre national de la Recherche pour l’Environnement, et l’Universite de Stanvanger (Norvege). Enfin, l’Institut heberge depuis decembre 2000 le Centre National de Donnees Oceanographiques (CNDO) finance par l’UNESCO/IOC dans le cadre du projet ODINAFRICA.